Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EDEM3Q9BZQ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM3Q9BZQ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms