Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms