Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms