Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NAP1L3Q99457 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms