Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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