Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC115Q96NT0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC115Q96NT0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms