Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMX3Q96JJ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMX3Q96JJ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms