Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP2Q96HF1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms