Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP6Q6ZN66 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms