Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms