Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XKR3Q5GH77 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms