Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCBP3Q53F19 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NCBP3Q53F19 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NCBP3Q53F19 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms