Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
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BRD3Q15059 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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BRD3Q15059 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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BRD3Q15059 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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BRD3Q15059 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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BRD3Q15059 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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BRD3Q15059 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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BRD3Q15059 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD3Q15059 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD3Q15059 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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