Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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