Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALCAMQ13740 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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