Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAPSNQ13702 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms