Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TOP3AQ13472 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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