Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF1Q13351 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF1Q13351 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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