Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHAF1AQ13111 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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