Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFX1Q12986 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NFX1Q12986 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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