Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms