Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms