Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP2P81877 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms