Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLCP48506 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLCP48506 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLCP48506 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLCP48506 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCLCP48506 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLCP48506 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLCP48506 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLCP48506 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLCP48506 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLCP48506 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLCP48506 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLCP48506 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCLCP48506 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLCP48506 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLCP48506 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLCP48506 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLCP48506 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms