Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSR1P43307 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSR1P43307 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSR1P43307 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSR1P43307 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR1P43307 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR1P43307 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR1P43307 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR1P43307 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR1P43307 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSR1P43307 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSR1P43307 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms