Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF93P35789 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms