Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPC1P35052 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPC1P35052 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPC1P35052 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPC1P35052 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPC1P35052 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPC1P35052 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPC1P35052 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPC1P35052 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GPC1P35052 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms