Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms