Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB2P29033 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB2P29033 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB2P29033 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB2P29033 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB2P29033 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB2P29033 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB2P29033 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB2P29033 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB2P29033 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB2P29033 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB2P29033 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB2P29033 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB2P29033 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms