Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NTF3P20783 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF3P20783 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms