Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB3BP20337 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms