Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCSHP14314 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms