Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms