Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFHP12036 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFHP12036 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEFHP12036 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEFHP12036 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEFHP12036 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEFHP12036 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFHP12036 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms