Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF6BO95407 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF6BO95407 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms