Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN11O75508 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms