Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB12Q9Y5F1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms