Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTDP1Q9Y5B0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDP1Q9Y5B0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms