Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC2Q9Y235 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC2Q9Y235 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms