Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms