Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMCO4Q9NRQ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms