Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIT2Q9NQR4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIT2Q9NQR4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms