Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM7Q9BQ49 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms