Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UHRF1Q96T88 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms