Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNBD2Q96M20 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms