Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PKNOX2Q96KN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKNOX2Q96KN3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms