Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCHS1Q96JQ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DCHS1Q96JQ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms