Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUNDC1Q96C34 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUNDC1Q96C34 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms