Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KBTBD3Q8NAB2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KBTBD3Q8NAB2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms