Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM20Q8N5G0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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